Sekcja koszykarska jest drugą ulubioną, po piłkarskiej oczywiście, wśród kibiców FC Barcelony. Założona została 24 sierpnia 1926 roku i swoje pierwsze mecze rozgrywała w kompleksie sportowym w Sol de Baix (obecnie między obecnymi Avinguda Madrid i Travessera de Les Corts). W pierwszych rozgrywkach wzięła udział jedna w latach 30., kiedy w Katalonii wykształciła się koszykówka . Po wojnie domowej, koszykarska FC Barcelona rozpoczęła grę w Primera Division na boisku umieszczonym za trybuną południową stadionu piłkarskiego w Les Corts. Na pierwsze sukcesy trzeba było czekać do lat 40. kiedy to Barca zdobyła sześciokrotnie mistrzostwo Hiszpanii.
Po kilku latach kryzysu, Blaugrana odrodziła się ponownie w sezonie 1958/59, kiedy wygrała zarówno ligę hiszpańską, jak i mistrzostwo Hiszpanii, po czym jednak przyszedł dość suchy dwudziestoletni okres, w którym najważniejszym wydarzeniem były przenosiny zespołu koszykarskiego do Palau Blaugrana. Wtedy najsilniejszą drużyną w Hiszpanii był Real Madryt. To właśnie Królewskich pokonała (103-96) Barcelona w finale Pucharu Króla w sezonie 1977-78, co rozpoczęło bogaty okres koszykówki w stolicy Katalonii.
Lata 80. to jeden z najlepszych okresów w historii Blaugrany, w barwach której występowali między innymi Antonio San Epifanio „Epi”, Nacho Solozabal i Chicho Sibillo. W 1980-81 zespół wygrał ligę hiszpańską po raz pierwszy od wielu lat. Oprócz kilku mistrzostw Hiszpanii, w tych latach Barcelonie udało się zdobyć pierwsze trofea na arenie międzynarodowej. W sezonie 1984/85, Duma Katalonii sięgnęła po Puchar Europy po finałowym zwycięstwie nad Żalgirisem Kowno, a w sezonie 1986/87 zdobyła Superpuchar Europy, po czym trzykrotnie z rzędu (w latach 1988-90) zdominowała rodzime rozgrywki.
W końcówce XX i na początku XXI wieku najważniejszymi postaciami w sekcji koszykarskiej Barcelony byli Juan Carlos Navarro, Rodrigo De la Fuente, Roberto Duenas i Pau Gasol. Na przestrzenie dziesięciu lat zespół zdobył cztery mistrzostwa Hiszpanii, trzy Puchary Króla i Puchar Koracza.
Jednakże największy sukces w historii sekcji został zanotowany w sezonie 2002-03, kiedy Barcelona, prowadzona przez Dejana Bodirogę, Sarunasa Jasikeviciusa i wspomnianego Navarro wygrała koszykarską Euroligę, po pokonaniu finale włoskiego Benettonu Treviso. W tym samym sezonie najlepszy zespół w Europie wygrał również Ligę ACB i Puchar Króla.
Ostatni sezon, 2008/09, również był dla Barcy udany. Zespół Xaviego Pascuala sięgnął po mistrzostwo Hiszpanii, pokonując w finale TAU Ceramikę Vitoria, a także zajął trzecie miejsce w Eurolidze.